-

tomasz-kurowski : człowiek od genomów ([email protected])

Komentarze użytkownika

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Popisowy numer Miczurina to była chyba grusza z jarzebiną, a to sporo bliżej niż wierzba. Jednak to prawda, rośliny są niebywale plastyczne, a botanicy mają różne niesamowite sposoby, o których ja mam nikłe pojęcie. Miałem niedawno przyjemność pracować z krzyżówkami pomidora z pewnym dzikim gatunkiem, powstałymi w drodze tak zwanego embryo rescue. Tu też widać pewną przewagę pracy nad roślinami w porównaniu z człowiekiem lub zwierzętami: można sobie ciąć i eksperymentować do woli i nikt nie skojarzy tego z "Wyspą doktora Moreau"...

Miczurin (on sam reputacyjnie, a jego dziedzina materialnie) chyba najbardziej ucierpiał pośmiertnie, kiedy zlepiono jego nazwisko z Łysenką i zadekretowano obowiązującą w całym bloku wschodni ...

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 20:09

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Trochę przydługo, bo planowałem krócej, ale jak już się człowiek rozpisze...

Muszę coś więcej o Mendlu doczytać, a może i napisać, bo to ciekawa postać, otoczona innymi ciekawymi postaciami (np. Aleksander Zawadzki, swoją drogą bielszczanin), a i samo tło jego pracy i jej publikacji jest ciekawe. Opublikował ją na początku roku 1866; parę miesięcy później wybuchła wojna prusko-austriacka, a Brno zajęli Prusacy. Sprawa z zakończeniem przez niego badań nad genetyką, a potem ich ponownym "odkryciem" na przełomie wieku też jest ciekawa, tak samo, jak jej tłumaczenia i interpretacje, kiedy budowano na tym fundamencie nowoczesną genetykę.

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 14:34

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Jest u nas instytut kryminalistyki i to zaskakujące, o jak wiele dziedzin zahacza.

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 14:31

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Interdyscyplinarność to istne bożyszcze badań naukowych, ale bywa z tym różnie, bo nawet w dość bliskich dziedzinach bywa, że mocno różnimy się językiem i podejściem. Przy okazji, już o tym parę razy wspominałem, ale w zasadzie jestem bioinformatykiem i, że tak się wyrażę, interesują mnie zazwyczaj bardziej środki niż cele. To znaczy: ta cała biologia jest ciekawa, dobrze ją znać, i przyjemnie się o niej mówi, bo pomidora i gruszę każdy widział, ale dla mnie to w sumie taka wymówka do grzebania przy sprytnych algorytmach :)

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 14:30

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Szczepienie jest w sumie o wiele starsze od jakkolwiek sformalizowanej genetyki, ale wierzba z gruszą to i tak zdecydowanie zbyt dalecy krewni na takie zabiegi :)

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 14:26

@O której jedzie pociąg do bujnych korzeni? (12 sierpnia 2024 06:00)

Dziękuję. Wyszło przydługo, ale starałem się, żeby nie było przynudno!

tomasz-kurowski
12 sierpnia 2024 09:59

@Dygresja pszenno-słomiana (4 sierpnia 2024 08:16)

W zasadzie od tego zaczynano, bo biopaliwa oparte na głównym, żywnościowym produkcie to tak zwane biopaliwa pierwszej generacji, a te oparte o produkty uboczne to druga generacja. Taki przynajmniej funkcjonuje branding.

Nawiasem mówiąc, "Chlor" chyba wywołany do odpowiedzi drugim linkiem Andrzeja :)

tomasz-kurowski
4 sierpnia 2024 15:11

@Dygresja pszenno-słomiana (4 sierpnia 2024 08:16)

Dziękuję za miły komentarz. Nie wiem, czy mam coś nowego i ciekawego do dodania do dyskusji na te tematy, ale może jeszcze do nich nawiążę. Piszę raczej od strony kalkulacji producenckich, bo to prędzej z nimi mam kontakt od strony badawczej (choć jeśli chodzi o zboża, jest on tak naprawdę dość ograniczony - siedzę bardziej w owocach i ogrodnictwie), a poza tym mam wrażenie, że to mniej powszechnie znane i dyskutowane sprawy.

tomasz-kurowski
4 sierpnia 2024 15:07

@Dygresja pszenno-słomiana (4 sierpnia 2024 08:16)

Istotnie, rolnik musi mierzyć się z ciekawymi kalkulacjami. Ten chlor z drugiego linku pochodzi zdaje się z pestycydów, więc widać jak sprawy powiązane są na różnych płaszczyznach.

Ciekawe, czy ten motyw Pól Elizyjskich pojawi się jakoś w drugiej części Gladiatora, bo scena jest zdecydowanie kultowa, a Hollywood lubi grać na taniej nostalgii.

tomasz-kurowski
4 sierpnia 2024 15:05

@Drugie zabicie św. Stanisława czyli księża historycy w akcji (3 sierpnia 2024 09:50)

Dodam jeszcze, że wydawnictwo wprawdzie oksfordzkie (OUP, duża marka, największe wydawnictwo uniwersyteckie na świecie), ale Frost pracuje na Uniwersytecie w Aberdeen, tym samym od publikacji pamiętników Gordona. W 2017 otrzymał też za tę książkę nagrodę od polskiego ministerstwa spraw zagranicznych za najlepszą publikację obcojęzyczną promującą historię Polski: https://dzieje.pl/aktualnosci/prof-frost-i-nowak-laureatami-konkursu-msz-na-najlepsza-publikacje-historyczna

"To wielki moment i pierwszy owoc Rady Dyplomacji Historycznej powołanej przy ministrze spraw zagranicznych."

tomasz-kurowski
3 sierpnia 2024 16:54

@Drugie zabicie św. Stanisława czyli księża historycy w akcji (3 sierpnia 2024 09:50)

Robert I. Frost, autor tej "Oksfordzkiej historii..." był doktorantem Normana Daviesa.

tomasz-kurowski
3 sierpnia 2024 16:33

@IX konferencja LUL w Krakowie - trzecia część „nieoficjalna” (30 lipca 2024 07:07)

Świetne zdjęcia i rozszerzenie walorów krajoznawczych! Muszę jednak częściej brać dłuższe urlopy wokół konferencji.

tomasz-kurowski
2 sierpnia 2024 21:02

@Trochę wspomnień w związku z dniem 2 sierpnia (2 sierpnia 2024 10:16)

Powtórzę się, że blog zainteresował mnie wydawnictwem, a wydawnictwo uwiarygodniło bloga, i tak oba skrzydła aktywności składają się w piękną całość. Dziękuję, gratuluję i życzę jeszcze wielu lat owocnej pracy i rozwoju działalności!

tomasz-kurowski
2 sierpnia 2024 14:18

@Piętnaście lat minęło jak jeden dzień (1 sierpnia 2024 09:38)

Jeszcze (pół-żartem) co do tego podziwiania: przyznam się, że czasem widząc poranną notkę zaczynam nie od czytania, a od przeklejenia do edytora tekstu, by zobaczyć liczbę słów!

tomasz-kurowski
1 sierpnia 2024 14:18

@Piętnaście lat minęło jak jeden dzień (1 sierpnia 2024 09:38)

Gratuluję rocznicy! Za czasów salonu24 zajmowały mnie inne rzeczy i tamtejsze notki nadgoniłem dopiero po odkryciu SN, więc nie należę wśród czytelników do weteranów, ale bardzo podziwiam wytrwałość, pracowitość i konsekwencję w rozwijaniu działalności blogerskiej i wydawniczej, a także w składaniu obu w sensowną całość.

tomasz-kurowski
1 sierpnia 2024 14:10

@Dygresja pszenno-galicyjska (23 lipca 2024 06:00)

Zażartuję, że można to odwrócić i to przodkowie trochę zależą od płci... rodziców :)

Częstotliwość rekombinacji jest bowiem różna dla komórek jajowych i plemników. Genomy dziadków ze strony matki są "dokładniej wymieszane" od genomów dziadków ze strony ojca. Jeśli dobrze pamiętam (nie siedzę raczej w ludzkiej genomice, a i w niej to szkopuł), to odchylenie standardowe w pokrewieństwie z dziadkami ze strony ojca odpowiada jakimś czterem punktom procentowym, a ze strony matki bliżej trzem. Na skalę populacji uśrednia się to do tych 25%, ale tak naprawdę każdy z nas jest o te kilka punktów procentowych bliżej / dalej spokrewniony z każdym z dziadków / babć. W typowej sytuacji najbliżej nam do kt&o ...

tomasz-kurowski
24 lipca 2024 14:12

@Dygresja pszenno-galicyjska (23 lipca 2024 06:00)

Mowy Disraeliego są trochę za długie i za męczące, by naprędce przekładać je w komentarzach, ale dam jeszcze krótki przykład stylu, w jakim atakował premiera. Popisowy fragment ze styczniowego przemówienia:

Oparliśmy się umiarkowanej propozycji Whigów. Odrzuciliśmy ją, ufając doświadczeniu owej wprawionej osobistości dżentelmena, który służył czterem monarchom. Byliśmy na tyle zaślepieni, by wierzyć, że dżentelmen o tak wielkich zdolnościach, o tak wieloletnim doświadczeniu obdarzony tak wielkimi atutami, nie może popełniać wielce rażących i namacalnych błędów. Przyjęliśmy go za przywódcę, by święcić triumf protekcji; teraz mamy uczestniczyć w jej katastrofie. Oczywiście głównymi żałobnikami będą Whigowie. Nie mog ...

tomasz-kurowski
23 lipca 2024 18:40

@Dygresja pszenno-galicyjska (23 lipca 2024 06:00)

Wolta w stanowisku Peela faktycznie raczej tłumaczona jest w kontekście sytuacji w Irlandii i ten wątek również był obecny w debacie. To zresztą nie był pierwszy raz, kiedy Peel nagle zmienił zdanie na przeciwne do "tradycyjnego" stanowiska Torysów, bo z katolicką emancypacją było podobnie, choć nie był wtedy jeszcze premierem. Disraeli charakteryzował sytuację w opisany sposób, bo taką sobie budował platformę polityczną.

W zasadzie w oryginalnym tekście (bo to drugi tekst powstały ze skrawków wykrojonych z notki o chlebie z Chorleywood) pobieżnie wiązałem ten kryzys Partii Konserwatywnej z biężączką, to znaczy obecnym jej kryzysem. Związek z galicyjskim rodowodem północnoamerykańskiej pszenicy wyszedł przy edycji. Więc dziś mam ...

tomasz-kurowski
23 lipca 2024 14:59

@Dygresja pszenno-galicyjska (23 lipca 2024 06:00)

Przodków o udziale poniżej 1% pominięto, więc całość może składać się nieco inaczej, ale to ciekawe liczby. Artykuł jest niestety z 1996 i używa dość archaicznych z dzisiejszej perspektywy metod, formułując wyniki na podstawie rodowodów, a nie genotypowania / sekwencjonowania genomów, co dość tanio można robić dzisiaj. Takie podejście trochę idealizuje sytuację i pomija niektóre efekty rekombinacji i selekcji. Nie znalazłem podobnego zestawienia na podstawie nowoczesnych danych, ale byłoby to do wykonania.

Problem zilustruję tak: wszyscy mamy 50% materiału genetycznego ze strony matki, a 50% ze strony ojca, ale już na etapie dziadków rozkład nie jest dokładnie po 25%... A nas żaden hodowca nie wybiera celowo na podstawie cech, k ...

tomasz-kurowski
23 lipca 2024 14:52

@Dygresja pszenno-galicyjska (23 lipca 2024 06:00)

Poniżej tabelka procentowego udziału przodków odmian chlebowej pszenicy jarej uprawianych w Ameryce Północnej, z publikacji w trzecim przypisie. Początkowo chciałem ją umieścić w notce lub samym przypisie, ale ostatecznie wklejam ją w komentarzu, bo zdradza zakończenie tekstu:

tomasz-kurowski
23 lipca 2024 06:12

 Poprzednia  Strona 6 na 60.    Następna